木ノ葉隠れの里の問題児・うずまきナルトの夢は、里１番の忍「火影」になること！“ドベ”の成績でなんとか忍者学校を卒業したナルトは、同期の「うちはサスケ」「春野サクラ」とともに、上忍「はたけカカシ」率いる第七班の チームへ編入される。

霧隠れの鬼人・桃地再不斬との死闘、苛烈極まる中忍試験、大蛇丸の陰謀による「木ノ葉崩し」での「砂瀑の我愛羅」との対決、「三忍」の１人・綱手を捜す旅、…数々の戦いを経て、ナルトは強く成長していく!!

そして変わっていったのは、ナルトの強さだけではない…かつて木ノ葉の里を襲った九尾の妖狐。ナルトの身体には、その九尾が封印されている。それゆえ、里の者は皆、ナルトを忌み嫌っていた…しかし、ひたむきに火影を目指し、前へ前へ進んでいくナルト。その姿を見ることで、また、時にはナルトと本気で戦った末に、皆はナルトを木ノ葉の一員として認めていくのであった。

紡がれていった、たくさんの仲間との絆…ナルトは、木ノ葉の里にて、しっかりとした自分の居場所を作ることができたのであった。

しかし、そのナルトの急成長に焦りを覚える者もいた。ナルトの最大のライバル・うちはサスケである。自分の一族を皆殺しにした実の兄・うちはイタチへの復讐を宿願とする彼は、さらなる力を求め、木ノ葉に仇なす大蛇丸のもとへと走るのであった。

ナルトは、仲間の奈良シカマル・日向ネジ・秋道チョウジ・犬塚キバとともに、サスケ奪還の任務に付くが、阻む音忍との戦い、そして終末の谷でのナルトとサスケ直接対決の末、ナルトは敗北、サスケは新たなる道へと進んでいく…

「絶対に諦めない」！サスケを取り戻すことを、その忍道に誓ったナルトは、師・自来也と修業の旅に出る。そして、今、さらに成長したナルトが木ノ葉の里に立つ!!